Veel 20. sajandi alguses oli ebapärlikarp Euroopas üsna tavaline, kuid praeguseks on selle asurkond terves maailmajaos kahanenud 90%. Sada miljonit aastat maakeral elanud liik on Eestiski alles vaid ühes Põhja-Eesti jões, mille nime ei tohi liigi kõrge kaitsekategooria tõttu avaldada.